GeneRead DNA FFPE Kit (50)
货 号：180134
产品规格：50
原 产 地：德国
参考价格：3360 （参考价格，以实际价格为准）
优惠价格：
产品详细信息
GeneRead DNA FFPE Kit (50)
180134
从FFPE组织样本中高效纯化基因组DNA，适合用于NGS分析
- 采用优化的裂解液，可从FFPE样品中高效回收gDNA
- 酶促反应去除胞嘧啶脱氨产物
- 最大限度减少假阳性SNP检出风险
- 在DNA测序应用中获得出色结果
- 可在QIAcube全自动核酸纯化仪上自动运行
GeneRead DNA FFPE Kit采用基于硅胶模离心柱的优化实验方案，能够从福尔马林固定、石蜡包埋（FFPE）组织样本中纯化出高品质基因组DNA。由于胞嘧啶的脱氨作用所导致 的C>T人为突变现象在二代测序技术中影响很大。此类人为突变由福尔马林固定以及样本老化所引发，会导致测序结果产生偏差。GeneRead FFPE纯化步骤中引入了酶促处理，能够消除此类人为突变，从而保证了基因组DNA的产量高、纯度好，特别适用于二代测序应用。
原理
从FFPE组织为二代测序制备DNA还有几个挑战。由于样品稀缺和DNA可能存在受损状况，DNA产量通常较为有限。此外，从有限材料开始的测序过程，往 往存在由于固定和包埋条件以及长期储存而产生的人为突变。这之中的一个特殊问题是，胞嘧啶碱基脱氨变成脱氧尿嘧啶，从而导致在测序反应中出现C-T转变。 此现象的确切机制尚未可知，可能的解释是胞嘧啶的脱氨作用导致在该位置产生了尿嘧啶，后者会与腺嘌呤配对。在测序过程中，这一改变随后会按照C>T 转换后的结果读取。如果在文库构建过程中链信息未能保留，则两条链都会被测序，这时此人为突变可能显示为C>T或G>A转换。很有必要去除这 些人为突变，特别是对于癌症样本的测序分析而言，因为这些干扰在此类样本中会被检测为假阳性。当进行FFPE样本测序时，由于起始原料有限而假阳性基因突 变的相对频率增加，避免人为突变至关重要。
GeneRead DNA FFPE Kit提供了一种从少量FFPE组织切片高效纯化高产率DNA的高效流程。此外，该流程包含去除脱氨基胞嘧啶的步骤，可避免DNA测序出现假阳性结果。
操作流程
在结合QIAamp MinElute柱之前进行脱蜡并对DNA样品的甲醛解交联。加热除去交联后，DNA就可以通过尿嘧啶DNA糖苷酶特异地去除脱氨基胞嘧啶残基。优化的反 应混合物提供了适宜的反应条件，使UNG能从FFPE样品的DNA中特异性去除人为导致的尿嘧啶。DNA结合到离心柱之后，经由Buffer AW1、Buffer AW2和乙醇洗去残留的杂质（比如盐）。残留的乙醇可能干扰随后的酶促反应，需另外由离心步骤彻底去除。DNA洗脱后可直接用于二代测序，也可在–20℃ 下储存。
GeneRead FFPE DNA kit也可在QIAcube全自动核酸纯化仪上自动运行。
应用
GeneRead DNA FFPE Kit可有效减少胞嘧啶脱氨人为突变，从FFPE样品中纯化出可直接供二代测序使用的DNA。
产品详细信息
GeneRead DNA FFPE Kit (50)
180134
从FFPE组织样本中高效纯化基因组DNA，适合用于NGS分析
- 采用优化的裂解液，可从FFPE样品中高效回收gDNA
- 酶促反应去除胞嘧啶脱氨产物
- 最大限度减少假阳性SNP检出风险
- 在DNA测序应用中获得出色结果
- 可在QIAcube全自动核酸纯化仪上自动运行
GeneRead DNA FFPE Kit采用基于硅胶模离心柱的优化实验方案，能够从福尔马林固定、石蜡包埋（FFPE）组织样本中纯化出高品质基因组DNA。由于胞嘧啶的脱氨作用所导致 的C>T人为突变现象在二代测序技术中影响很大。此类人为突变由福尔马林固定以及样本老化所引发，会导致测序结果产生偏差。GeneRead FFPE纯化步骤中引入了酶促处理，能够消除此类人为突变，从而保证了基因组DNA的产量高、纯度好，特别适用于二代测序应用。
原理
从FFPE组织为二代测序制备DNA还有几个挑战。由于样品稀缺和DNA可能存在受损状况，DNA产量通常较为有限。此外，从有限材料开始的测序过程，往 往存在由于固定和包埋条件以及长期储存而产生的人为突变。这之中的一个特殊问题是，胞嘧啶碱基脱氨变成脱氧尿嘧啶，从而导致在测序反应中出现C-T转变。 此现象的确切机制尚未可知，可能的解释是胞嘧啶的脱氨作用导致在该位置产生了尿嘧啶，后者会与腺嘌呤配对。在测序过程中，这一改变随后会按照C>T 转换后的结果读取。如果在文库构建过程中链信息未能保留，则两条链都会被测序，这时此人为突变可能显示为C>T或G>A转换。很有必要去除这 些人为突变，特别是对于癌症样本的测序分析而言，因为这些干扰在此类样本中会被检测为假阳性。当进行FFPE样本测序时，由于起始原料有限而假阳性基因突 变的相对频率增加，避免人为突变至关重要。
GeneRead DNA FFPE Kit提供了一种从少量FFPE组织切片高效纯化高产率DNA的高效流程。此外，该流程包含去除脱氨基胞嘧啶的步骤，可避免DNA测序出现假阳性结果。
操作流程
在结合QIAamp MinElute柱之前进行脱蜡并对DNA样品的甲醛解交联。加热除去交联后，DNA就可以通过尿嘧啶DNA糖苷酶特异地去除脱氨基胞嘧啶残基。优化的反 应混合物提供了适宜的反应条件，使UNG能从FFPE样品的DNA中特异性去除人为导致的尿嘧啶。DNA结合到离心柱之后，经由Buffer AW1、Buffer AW2和乙醇洗去残留的杂质（比如盐）。残留的乙醇可能干扰随后的酶促反应，需另外由离心步骤彻底去除。DNA洗脱后可直接用于二代测序，也可在–20℃ 下储存。
GeneRead FFPE DNA kit也可在QIAcube全自动核酸纯化仪上自动运行。
应用
GeneRead DNA FFPE Kit可有效减少胞嘧啶脱氨人为突变，从FFPE样品中纯化出可直接供二代测序使用的DNA。